鼠类保护自己的主要本领是隐蔽，以洞穴、缝隙、夹层等作为巢穴，借以居住和繁育昆裔。野鼠的巢穴多数为自，少数利用天然缝隙、孔洞；但家鼠不同。跟着人们糊口前提的改善，泥墙、土地日渐减少，家鼠自己挖洞的机会也在减少，越来越多地利用下水道、夹层建筑孔隙以至家具、久不翻动的杂物和衣被等躲藏栖息。不同家鼠的栖息场所各有侧重，黄胸鼠多在建筑物的上层栖息褐家鼠喜在基层比较湿润处，如阴沟、下水道等栖息；小家鼠常在家具、杂物堆里栖息，较少进入顶层。因为多利用现成空间，家鼠巢穴常无定式，垫巢物多为碎布、废纸，杂物或树叶、棉花等，通常没有固定的仓库。野鼠的洞穴和窝巢则各有特色，不仅有较松软的窝巢，有的还有储食的仓库以及厕所、气孔等冬眠鼠的窝巢筑在冻层以下，冬眠前堵严洞口然后蛰眠。
